VDU Žemės ūkio akademijos istorijos muziejus įkurtas 1974 m. spalio mėn. – Akademijos 50-mečio išvakarėse, rektorato iniciatyva, įkūrėja – Nijolė Bėčienė.
Šiuo metu šis muziejus yra įsikūręs Centrinių rūmų pirmame aukšte ir pasitinka lankytojus K. Jasiūno žodžiais: „Mokslo ribų nėra. Tai visada nebaigtas pastatas, visada be stogo. Visą gyvenimą teks tą pastatą statyti ir statyti“.